ترور کشیشان مسیحی و قتل یا اعدام پیروان سایر ادیان و عقاید، یکی از عملکردهای ننگین رژیم آخوندی در نقض حقوق‌بشر می‌باشد:
ـ6مه 1980: قتل بهرام دهقانی با رگبار مهاجمان
ـ‌ 3دسامبر 1990: اعدام کشیش حسین سودمند، به اتهام ارتداد از اسلام،
6ژوئن 1994: کشیش مهدی دیباج ربوده شد. جسد قطعه قطعه شده وی، در یک منطقه متروکه پیدا شد
31ژانویهٔ 1994: جسد اسقف هائیک هوسپیان مهر در نزدیکی تهران پیدا شد.
29ژوئن 1994: اسقف تدهیس میکائیلیان در تهران ربوده و همان شب به‌قتل رسید.
یهودیان و زرتشتیان به جرم اعتقاد مذهبی کشته می‌شوند:
ـ 24فوریه 1994: قتل فیض‌الله مخوبات، خادم کنیسه،
ـ اکتبر 1995: اعدام دکتر احمد فرزانه، زرتشتی 67‌ساله،
ـ‌ ژوئن 1996: حلق‌آویز مشکوک هم‌میهن یهودی عزیز‌الله لامع، 61ساله
ـ 23دسامبر 1995: گزارشگر ویژه کمیسیون حقوق‌بشر ملل متحد: تا سال 1992بیش از 200بهایی اعدام شدند.